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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
23/01/2019 |
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Data da última atualização: |
23/01/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. |
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Afiliação: |
SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; Giovanna Gabrielle Cruvinel, UNICEP; Caroline Valério Moraes, UFSCar; FLAVIA ALINE BRESSANI DONATONI, CPPSE; WILSON MALAGO JUNIOR, CPPSE; MAGDA VIEIRA BENAVIDES, CPPSUL; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
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Título: |
PCR-based genotyping of SNP markers in sheep. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 45, n. 4, p. 651-654, Aug. 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-018-4206-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the main type of variation in genome, enabling them to be associated with traits of economic importance in livestock. Genome-wide association studies (GWAS) have led to the discovery of SNPs associated with desirable traits in sheep. However, in these studies, SNPs are genotyped by high-throughput methods in genome scale, which are expensive and require sophisticated equipment and analysis methods. Therefore, the goal of this study was to develop a reliable, rapid, and inexpensive polymerase chain reaction (PCR)-based method to genotype a medium number of animals for a few candidate SNPs previously associated with desirable phenotypes in sheep by GWAS, using markers associated with gastrointestinal nematode resistance as a model. DNA extracted from white-blood cells of 150 sheep was submitted to PCR amplification followed by agarose gel electrophoresis and determination of banding pattern. Tetra-primer ARMS-PCR was successfully optimized after changes in annealing temperature; annealing and extension times; concentration of MgCl2 and DNA; ratios of inner, outer, forward and reverse primer; and addition of adjuvants, for genotyping the OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, and OAR12_69606944 SNPs in sheep. An extensive optimization of tetra-primer ARMS-PCR resulted in a suitable, simple, cost-effective PCR-based method of genotyping four SNP markers previously detected by chip arrays. |
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Palavras-Chave: |
PCR RFLP; Resistência nematódeo gastrintestinal; Tetra primer ARMS PCR. |
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Thesagro: |
Marcador Molecular; Ovino. |
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Thesaurus Nal: |
Genome. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
23/12/2014 |
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Data da última atualização: |
03/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVA, L. C. da; RIBEIRO, S. M.; LEMOS, W. de P.; OLIVEIRA, T. A. de; FRANÇA, L. P. N.; ARAUJO, M. R. de. |
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Afiliação: |
LEANDRO C. DA SILVA, BOLSISTA PIBIC; SUELEM M. RIBEIRO, ENGENHEIRA AGRÔNOMA; WALKYMARIO DE PAULO LEMOS, CPATU; TACIANE A. DE OLIVEIRA, DOUTORANDA UFRA; LUANA P. N. FRANÇA, ACADÊMICA IFPA; MAYARA R. DE ARAUJO, UFRA. |
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Título: |
Artropodofauna edáfica associada a cultivos de açaí (Euterpe oleraceae) em municípios do Nordeste paraense. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SEMINÁRIO ANUAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 12., 2014, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Universidade Federal Rural da Amazônia, 2014. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Objetivou-se avaliar o período do ano com maior abundância da artropodofauna edáfica, com ênfase nos predadores, em dois sistemas de cultivo de açaí nos municípios de Igarapé-açu e Marapanim, PA. A coleta dos artrópodes foi realizada com armadilhas tipo Pitfall. Foram realizadas quatro coletas, nos seguintes períodos: chuvoso (CH), transição chuvoso-seco (CH/SE), seco (SE) e transição seco-chuvoso (SE/CH). As armadilhas foram enterradas no solo, e continham solução aquosa de sabão líquido neutro e cloreto de sódio. Cada armadilha permaneceu 48 horas no campo. Os períodos do ano que mais favoreceram a presença de artrópodes de solo, independente das áreas de cultivo, foram CH/SE e SE/CH. Na área de Sistema Agro Florestal, os grupos de artrópodes mais abundantes foram Hymenoptera (Formicidae), representando 96,56% dos indivíduos coletados, enquanto, que em sistema de monocultivo as formigas representaram 92,39% da artropodofauna. Conclui-se que a precipitação pluviométrica influenciou na abundância das populações dos artrópodes de solo em ambos sistemas de cultivo de açaí. |
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Palavras-Chave: |
Artrópodes; Pará; SAF; Sistema agroflorestal. |
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Thesagro: |
Açaí. |
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Categoria do assunto: |
O Insetos e Entomologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114359/1/resumoLeandro.pdf
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Marc: |
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245 $aArtropodofauna edáfica associada a cultivos de açaí (Euterpe oleraceae) em municípios do Nordeste paraense.$h[electronic resource]
260 $aIn: SEMINÁRIO ANUAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 12., 2014, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Universidade Federal Rural da Amazônia$c2014
520 $aObjetivou-se avaliar o período do ano com maior abundância da artropodofauna edáfica, com ênfase nos predadores, em dois sistemas de cultivo de açaí nos municípios de Igarapé-açu e Marapanim, PA. A coleta dos artrópodes foi realizada com armadilhas tipo Pitfall. Foram realizadas quatro coletas, nos seguintes períodos: chuvoso (CH), transição chuvoso-seco (CH/SE), seco (SE) e transição seco-chuvoso (SE/CH). As armadilhas foram enterradas no solo, e continham solução aquosa de sabão líquido neutro e cloreto de sódio. Cada armadilha permaneceu 48 horas no campo. Os períodos do ano que mais favoreceram a presença de artrópodes de solo, independente das áreas de cultivo, foram CH/SE e SE/CH. Na área de Sistema Agro Florestal, os grupos de artrópodes mais abundantes foram Hymenoptera (Formicidae), representando 96,56% dos indivíduos coletados, enquanto, que em sistema de monocultivo as formigas representaram 92,39% da artropodofauna. Conclui-se que a precipitação pluviométrica influenciou na abundância das populações dos artrópodes de solo em ambos sistemas de cultivo de açaí.
650 $aAçaí
653 $aArtrópodes
653 $aPará
653 $aSAF
653 $aSistema agroflorestal
700 1 $aRIBEIRO, S. M.
700 1 $aLEMOS, W. de P.
700 1 $aOLIVEIRA, T. A. de
700 1 $aFRANÇA, L. P. N.
700 1 $aARAUJO, M. R. de
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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